понедельник, 4 мая 2015 г.

R и клинические исследования. Обзор литературы (вернее, её отсутствия)

Так получилось, что для статистического анализ результатов клинических испытаний стандартом де-факто является SAS. Доступно большое количество соответствующей литературы, в том числе с готовыми примерами кода - бери и пользуйся (если не смущает цена лицензионной версии данного программного продукта). Также популярно такое коммерческое ПО, как SPSS и Stata. Ну а поскольку свободное ПО в лице языка R наступает по всем фронтам, интересно оценить, как обстоят дела с литературой по использованию R в этой сфере.


Мне удалось найти всего одну (!) книгу, полностью посвященную анализу данных клинических испытаний с использованием R. Вот она: Clinical Trial Data Analysis Using R. Авторы пытались охватить широкий спектр вопросов - от оценки размера выборок до мета-анализа и анализа данных ДНК-микрочипов - и не раскрыли в подробностях ни один из них. Читать книгу стоит для ознакомления и общего развития, чтобы понимать, на что обращать внимание при изучении более фундаментальной литературы.
Достаточно хорошо обстоят дела с популяризацией использования R для анализа результатов исследований биоэквивалентности: многие презентации, доступные на сайте bebac.at, содержат примеры кода на R (пример презентации; сообщение в блоге по мотивам). А вот литературного первоисточника в книжном формате, пригодного для изучения темы "от А до Я" и удобного для цитирования, пока что нету.
Что касается регуляторных аспектов:
В общем, есть повод для оптимизма по поводу использования R для анализа данных клинических испытаний.

Комментариев нет:

Отправить комментарий