среда, 20 декабря 2023 г.

CAFA 5 Protein Function Prediction

Вступление

20 декабря 2023 г. закончилось соревнование CAFA5: активная фаза длилась с середины апреля по конец августа, затем ждали результатов на честном тестовом наборе данных, собранном после окончания приема сабмитов. Маленькая команда R-щиков в составе Антонины Долгоруковой и меня выступила достаточно успешно, заняв 16 место на публичном лидерборде и 13 на приватном, буквально на десятитысячных долях (kaggle-style) дотянув до золотой медали. Можно ознакомиться с кратким описанием решения, ну а в этом сообщении рассказывается максимально подробно, что делали в ходе соревнования, чему научились и на чем обломались.